(2016年12月6日)
研究振興局長（総括審議官）関靖直（せきやすなお）
退任（研究振興局長）小松弥生
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(2016年6月21日)
事務次官（文部科学審議官）前川喜平
退任（事務次官）土屋定之
文部科学審議官（初等中等教育局長）小松親次郎（こまつしんじろう）
官房長（総括審議官）佐野太（さのふとし）
初等中等教育局長（官房長）藤原誠（ふじわらまこと）
総括審議官（サイバーセキュリティ・政策評価審議官）関靖直（せきやすなお）
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(2016年4月1日)
サイバーセキュリティ・政策評価審議官（政策評価審議官）関靖直
兼審議官高大接続・初等中等教育局担当、浅田和伸
審議官研究開発局担当（官房参事官）白間竜一郎
もんじゅ改革監（東北大理事）明野吉成
文化部長（官房付）内丸幸喜
官房参事官、笠原隆
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(2015年8月4日)
事務次官（文部科学審議官）土屋定之（つちやさだゆき）
文部科学審議官（官房長）戸谷一夫（とだにかずお）
官房長（高等教育局私学部長）藤原誠（ふじわらまこと）
高等教育局長（研究振興局長）常盤豊（ときわゆたか）
研究振興局長（独立行政法人国立美術館理事）小松弥生（こまつやよい）
スポーツ・青少年局長（内閣官房教育再生実行会議担当室長）高橋道和（たかはしみちやす）
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